RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GWB2 263 aa10.13□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 NPFFO15130 113 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 APOMO95445 188 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 EVI2AP22794 236 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 LY6DQ14210 128 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 AKAP6Q13023 2319 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM8BA6NDV4 472 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 LMO4P61968 165 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM219Q86XT9 240 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 RNF185Q96GF1 192 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 METTL26Q96S19 204 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 FCER1GP30273 86 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 RRN3P1Q2M238 152 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 SYT8Q8NBV8 401 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 CDIP1Q9H305 208 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM160Q9NX00 188 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 DPM2O94777 84 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01559Q495D7 138 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV40A0A0B4J280 105 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 RBAKDNA6NC62 111 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 MT-ATP8P03928 68 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H4GQ99525 98 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 SPINK8P0C7L1 97 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 GATA3P23771 443 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 FHL3Q13643 280 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TNFRSF6BO95407 300 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 FOXI1Q12951 378 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 PSMG4Q5JS54 123 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD1-202ENST00000375175 GLMPQ8WWB7 406 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 CNFNQ9BYD5 112 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 KLK9Q2XQG4 91 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 NFE4Q86UQ8 179 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf92Q96LL3 132 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01546A6NGU7 62 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DRB4P13762 266 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 TRGV3P03979 118 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 XGP55808 180 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 TAL2Q16559 108 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 C19orf84I3L1E1 186 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZQT7 251 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 RNF183Q96D59 192 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 J3KRW8 73 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 ATP5LO75964 103 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN13O95857 204 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZUT4 128 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 ARL3P36405 182 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 SFTA2Q6UW10 78 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 U3KQE9 123 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 PTH2Q96A98 100 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa10.03□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 FAM223BA6NKX1 122 aa10.03□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV4-39P01824 125 aa10.03□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 LY6EQ16553 131 aa10.03□□□□□ -0.8
TMOD1-202ENST00000375175 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.3 ms