RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 COL8A2P25067 703 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFS7O75251 213 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 COX17Q14061 63 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 U3KQK5 164 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 EREGO14944 169 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 FHL1Q13642 323 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 ETDBQ3ZM63 59 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf86Q6ZUL3 223 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 TNCP24821 2201 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 LY6EQ16553 131 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 C14orf177Q52M58 125 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 KLK15Q9H2R5 256 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf65H3BRN8 121 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1D-12P01611 117 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PYYP10082 97 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 FAM201AQ5SY85 155 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 hDV102S1A0JD36 115 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGLL5B9A064 214 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 H3BUX3 64 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf74Q96GX8 76 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF876PQ49A33 203 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LHBP01229 141 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 Q0VFX4 171 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 SPRY4Q9C004 299 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 AMTNQ6UX39 209 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 U3KQA8 63 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JNJ9 132 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GXF2 115 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 CRYGCP07315 174 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 Q9UFV3 132 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LGALS9O00182 355 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF580Q9UK33 172 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PINLYPA6NC86 204 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00479Q96M42 142 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2AP49459 152 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WV48 116 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 GNG5P63218 68 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PLCE1Q9P212 2302 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PSMB8P28062 276 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LYPD6Q86Y78 171 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 COL4A2P08572 1712 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 INSL3P51460 131 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 CNFNQ9BYD5 112 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 BRI3O95415 125 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 MIAQ16674 131 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 PRORYQ9H606 182 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00473A8K010 186 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 CD177Q8N6Q3 437 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 GTSF1Q8WW33 167 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 CFHR4Q92496 578 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf56Q8N813 242 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TIRAPP58753 221 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 MORN5Q5VZ52 161 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 COX7A2LO14548 114 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 TFPI2P48307 235 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-201ENST00000355233 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms