RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 MTURNQ8N3F0 131 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 A1L4Q6 167 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 HBDP02042 147 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ARL3P36405 182 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.61□□□□□ -1.35
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GINS1-201ENST00000262460 METTL26Q96S19 204 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 MUC4Q99102 2169 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 H3BUT2 72 aa6.61□□□□□ -1.35
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GINS1-201ENST00000262460 LINC00477Q96M19 166 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 COX8AP10176 69 aa6.61□□□□□ -1.35
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GINS1-201ENST00000262460 PAX8Q06710 450 aa6.61□□□□□ -1.35
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GINS1-201ENST00000262460 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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GINS1-201ENST00000262460 EBI3Q14213 229 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.6□□□□□ -1.35
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GINS1-201ENST00000262460 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 SAP30O75446 220 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 GCSHP23434 173 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 BMI1P35226 326 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ATP5J2P56134 94 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FCER1GP30273 86 aa6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 PCP4P48539 62 aa6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 APCP25054 2843 aa6.59□□□□□ -1.35
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WWL8 130 aa6.59□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.59□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.59□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 U3KQK5 164 aa6.59□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 DEFB125Q8N687 156 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 SMIM17P0DL12 118 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 FXYD2P54710 66 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.58□□□□□ -1.36
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GINS1-201ENST00000262460 DUX3Q96PT4 197 aa6.58□□□□□ -1.36
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GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-69P01742 117 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 Q6AWC8 147 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RBX1P62877 108 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 ODF1Q14990 250 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 ITPR3Q14573 2671 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 ITPR2Q14571 2701 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-59P01825 116 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 ZNF688P0C7X2 276 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 UCNP55089 124 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RIPPLY3P57055 190 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 DEFB136Q30KP8 78 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 LINC01559Q495D7 138 aa6.56□□□□□ -1.36
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GINS1-201ENST00000262460 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.56□□□□□ -1.36
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GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 GAGE12BA1L429 117 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 S100A7AQ86SG5 101 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GW15 77 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 OOSP1A8MZH6 123 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 F5H697 171 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 SCGB2A1O75556 95 aa6.54□□□□□ -1.36
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