RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 AJUBAQ96IF1 538 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 CTSZQ9UBR2 303 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 GTF3C1Q12789 2109 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C20orf78Q9BR46 151 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C15orf65H3BRN8 121 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 GNRH2O43555 120 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 UTF1Q5T230 341 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C14orf177Q52M58 125 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 HIVEP2P31629 2446 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFA1O15239 70 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 GPHB5Q86YW7 130 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087WW49 117 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB4AO15263 64 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 MPV17L2Q567V2 206 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 UBE2CO00762 179 aa8.27□□□□□ -1.08
TRPS1-201ENST00000220888 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 J3QQQ9 107 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 HERV-K104P63124 156 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 FGF6P10767 208 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ARID2Q68CP9 1835 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 Q9H8V8 135 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 SBF1O95248 1867 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 HLA-DMBP28068 263 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 RBAKDNA6NC62 111 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 C2orf70A6NJV1 201 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF124Q15973 351 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 MED13LQ71F56 2210 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 LTBP1Q14766 1721 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 F8VRH5 84 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 SPRY2O43597 315 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 NPYP01303 97 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 HILS1P60008 231 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 NPBQ8NG41 125 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 TRACP01848 142 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ARTNQ5T4W7 220 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 B9D2Q9BPU9 175 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 KLK12Q9UKR0 248 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 LCTP09848 1927 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM89A2RUT3 159 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 A8MWP6 167 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 POU2AF1Q16633 256 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 INAFM1C9JVW0 142 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 FXYD5Q96DB9 178 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 COX11Q9Y6N1 276 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 ACACBO00763 2458 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 CARD19Q96LW7 228 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 CYYR1Q96J86 154 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA25Q9BR10 227 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-201ENST00000220888 COL4A6Q14031 1691 aa8.22□□□□□ -1.09
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