RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF688P0C7X2 276 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IAPPP10997 89 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 MYOD1P15172 320 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C18orf15Q96N68 181 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SPINK4O60575 86 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SNCGO76070 127 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ASIPP42127 132 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RASL10AQ92737 203 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RITA1Q96K30 269 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01587Q99440 93 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 AVPP01185 164 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 HES1Q14469 280 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 APCP25054 2843 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C9JAW5 83 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTL6BO94805 426 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00694P0DN24 101 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 CNTFRP26992 372 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PLGLAQ15195 96 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 VWC2Q2TAL6 325 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 SGK494Q96LW2 274 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ASCL2Q99929 193 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL15Q9H469 300 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf62A8K5M9 175 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 GGTLC3B5MD39 225 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF6BO95407 300 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ORM1P02763 201 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 GCSHP23434 173 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf83Q53S99 150 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DL4Q99706 377 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 CGB1A6NKQ9 187 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 FXYD2P54710 66 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 RRN3P1Q2M238 152 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 SPINK9Q5DT21 86 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 NFE4Q86UQ8 179 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 TEN1Q86WV5 123 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 PIFOQ8TCI5 191 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM101Q96IK0 257 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00479Q96M42 142 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 ORM2P19652 201 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 TAL2Q16559 108 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N9W7 124 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 NUP35Q8NFH5 326 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 PDZD2O15018 2839 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NDX4 124 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 CD24P25063 80 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 EMP1P54849 157 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPWQ5EE01 88 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 CEND1Q8N111 149 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-211ENST00000493660 CARD19Q96LW7 228 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms