RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV1-69P01742 117 aa16.84■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF138P52744 262 aa16.84■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CST9LQ9H4G1 147 aa16.84■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPBPP02775 128 aa16.83■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPS25Q9BRG1 176 aa16.83■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP5J2P56134 94 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF182Q8N6D2 247 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM190Q8WZ59 177 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOSR1O95249 250 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB125Q8N687 156 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIFOQ8TCI5 191 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LY6EQ16553 131 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM162BQ5T6X4 162 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRR25Q96S07 402 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM189A5PLL7 270 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BUB3O43684 328 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSN3P07498 182 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIGQ13278 110 aa16.81■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H0Y8G0 127 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERCC8Q13216 396 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OCIAD2Q56VL3 154 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CACNA1AO00555 2505 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRAC2D3DTV9 90 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPG11Q96JI7 2443 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV41A0A0B4J266 112 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRGNQ92686 78 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDFIP1Q9BT67 221 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FLNCQ14315 2725 aa16.79■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP5G2Q06055 141 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A087X0K7 114 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM213A2RRL7 107 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CELSR2Q9HCU4 2923 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa16.77■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PMCHL2Q9BQD1 86 aa16.77■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLK9Q2XQG4 91 aa16.77■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.77■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.77■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 S100A7P31151 101 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRGV3P03979 118 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM15Q7Z3B0 74 aa16.75■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 METTL26Q96S19 204 aa16.75■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6AWC8 147 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BUX3 64 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXE3Q13461 319 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PET117Q6UWS5 81 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CD5LO43866 347 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV12-3P01733 135 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ORM1P02763 201 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAB9AP51151 201 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AMN1Q8IY45 258 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GAGE12BA1L429 117 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDUFS8O00217 210 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR5AL1P0C617 328 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL17RELQ6ZVW7 336 aa16.72■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNAI2O43623 268 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MSMBP08118 114 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COX8CQ7Z4L0 72 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1B0GW15 77 aa16.71■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRB1P04280 392 aa16.71■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BMI1P35226 326 aa16.71■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BLCAPP62952 87 aa16.71■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6ZS46 218 aa16.71■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MS4A6AQ9H2W1 248 aa16.71■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.7■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3-11P01762 117 aa16.7■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.7■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.7■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSPB8Q9UJY1 196 aa16.7■□□□□ 0.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACACBO00763 2458 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms