RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 NUPR1O60356 82 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SPINK4O60575 86 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 PPBPP02775 128 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 CTSGP08311 255 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 PRNTQ86SH4 94 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 Q86TA4 180 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 PRORYQ9H606 182 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 PLXNB1O43157 2135 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 ABCA4P78363 2273 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 A0A087X0K7 114 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 FAM223BA6NKX1 122 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 NPFFO15130 113 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 LEPROTL1O95214 131 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 IGLV2-11P01706 119 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 GNG5P63218 68 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SLC35B1P78383 322 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 ATP5G2Q06055 141 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SLAQ13239 276 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 A0A0G2JLM5 398 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 BUB3O43684 328 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC3BP05452 202 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 NTF3P20783 257 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 HILS1P60008 231 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 LMO4P61968 165 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 SPATA45Q537H7 98 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 Q8N9W7 124 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 GTSF1Q8WW33 167 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 CFAP54Q96N23 3096 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 ABCA1O95477 2261 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 COL6A3P12111 3177 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.47□□□□□ -1.85
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