RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404		U3KQE9	123 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	BATF	Q16520	125 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	ERCC8	Q13216	396 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404		D6R8Y8	96 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	FA2H	Q7L5A8	372 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	METTL26	Q96S19	204 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	CBY3	A6NI87	242 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	LINC01545	Q5VT33	79 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	STPG4	Q8N801	248 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FADS3-208	ENST00000529404		A0A096LNJ9	63 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	ORM1	P02763	201 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	TWIST1	Q15672	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	hDV102S1	A0JD36	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	TFPI2	P48307	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	BRI3	O95415	125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IGF1	P05019	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	CCL19	Q99731	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	VPS25	Q9BRG1	176 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	TRGV3	P03979	118 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	CKS2	P33552	79 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	NPY	P01303	97 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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