RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510171.3

DDX41-211, Transcript of DEAD-box helicase 41, humanhuman

TSL 3

Gene DDX41, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41-211ENST00000510171 PRAF2O60831 178 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX41-211ENST00000510171 LEPP41159 167 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 LINC00315P59091 139 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 PDE6HQ13956 83 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 KIR3DS1Q14943 382 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 NMES1Q9C002 83 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 PRAC2D3DTV9 90 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 E5RGE8 158 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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DDX41-211ENST00000510171 A0A096LPF7 62 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 SIVA1O15304 175 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 XGP55808 180 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 NHLH2Q02577 135 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX41-211ENST00000510171 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 A6NHS1 94 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 J3KRW8 73 aa7.14□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 CT45A10P0DMU9 189 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 DEFA3P59666 94 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 ERVFC1-1P60608 527 aa7.14□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 FRZBQ92765 325 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 NDUFB4O95168 129 aa7.13□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 NXPH4O95158 308 aa7.12□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 NFE4Q86UQ8 179 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 BLNKQ8WV28 456 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 C18orf15Q96N68 181 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.12□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.12□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 KLLNB2CW77 178 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 H0YIZ8 118 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 SSNA1O43805 119 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.11□□□□□ -1.27
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DDX41-211ENST00000510171 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 ATP5SQ99766 215 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 OR51M1Q9H341 326 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 FUT9Q9Y231 359 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX41-211ENST00000510171 A0A087WTM6 91 aa7.1□□□□□ -1.27
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