RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	-1.14	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	-1.14	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	SOGA1	O94964	1423 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM114	B3SHH9	223 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	KLKP1	Q107X0	134 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	LIN52	Q52LA3	116 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	BTF3L4	Q96K17	158 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	ABCA1	O95477	2261 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	UNC13B	O14795	1591 aa		-1.16	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	ADCY9	O60503	1353 aa		-1.16	□□□□□ -2.59
TTC3-222	ENST00000491952	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	HIGD1C	A8MV81	97 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	HBB	P68871	147 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	-1.16	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PPB8	328 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	ATP5H	O75947	161 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	IGF2	P01344	180 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	MT-ND6	P03923	174 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CEBPG	P53567	150 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	BIN3	Q9NQY0	253 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CAD	P27708	2225 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	MYO7A	Q13402	2215 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	ANK1	P16157	1881 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CPD	O75976	1380 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	IFNA14	P01570	189 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	FABP4	P15090	132 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	NAT14	Q8WUY8	206 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	-1.18	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	NDUFC2	O95298	119 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	IGKC	P01834	107 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	SNCB	Q16143	134 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	ISOC1	Q96CN7	298 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	NCAPD3	P42695	1498 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CD109	Q6YHK3	1445 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	GNG5	P63218	68 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952		Q5XG85	94 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	DSCR8	Q96T75	97 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PTPN13	Q12923	2485 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	-1.2	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	RTL9	Q8NET4	1388 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952		A0A0G2JMM0	328 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	TRAC	P01848	142 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	NMB	P08949	121 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CST2	P09228	141 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	RREB1	Q92766	1687 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	-1.21	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952		G3V2T6	193 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952		H7BYZ3	331 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PRM1	P04553	51 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	IL7	P13232	177 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CCL7	P80098	99 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	SPA17	Q15506	151 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	CLEC2B	Q92478	149 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	PRND	Q9UKY0	176 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	HERC1	Q15751	4861 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
TTC3-222	ENST00000491952	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		-1.22	□□□□□ -2.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	-1.23	□□□□□ -2.61
TTC3-222	ENST00000491952	ARL5C	A6NH57	179 aa		-1.23	□□□□□ -2.61

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