RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 VGLL1Q99990 258 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 PROK1P58294 105 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 FHL3Q13643 280 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 RPEL1Q2QD12 228 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 LCE1DQ5T752 114 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 PRNTQ86SH4 94 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 RNF182Q8N6D2 247 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 DCANP1Q8TF63 244 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 PRR25Q96S07 402 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 C2orf70A6NJV1 201 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 INAFM1C9JVW0 142 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CD28P10747 220 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CBLN1P23435 193 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CSN1S1P47710 185 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 SYNJ2BPP57105 145 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CT83Q5H943 113 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 C8orf49Q96NF6 230 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ASCL2Q99929 193 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 NRN1Q9NPD7 142 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 LINC01619G3V211 115 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 K7EQM0 130 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CRLF1O75462 422 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 S100PP25815 95 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 SLURP1P55000 103 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP10-3P60369 221 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 DEFB136Q30KP8 78 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 TCF24Q7RTU0 167 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 OR11H1Q8NG94 326 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 BIN3Q9NQY0 253 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1W2PPQ1 181 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 K7EQG2 157 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 TRGC2P03986 189 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CSN3P07498 182 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ERCC8Q13216 396 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 TSKUQ8WUA8 353 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 GTSF1Q8WW33 167 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 RAX2Q96IS3 184 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 FAM231BA6NCW3 169 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 PRR27Q6MZM9 219 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 Q8TAT8 98 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 FRZBQ92765 325 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 BTF3L4Q96K17 158 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 C16orf92Q96LL3 132 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1B0GXF2 115 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 C5orf52A6NGY3 159 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 OVOL1O14753 267 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 CT45A10P0DMU9 189 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF138P52744 262 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 ZFP82Q8N141 532 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 NUP35Q8NFH5 326 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 DUX3Q96PT4 197 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 NEU1Q99519 415 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA6-210ENST00000475302 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms