RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP1-206ENST00000469947 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXC2Q99958 501 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP1-206ENST00000469947 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP1-206ENST00000469947 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 SHISA9B4DS77 424 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 C16orf97H3BN30 126 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMG4Q5JS54 123 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE12HA6NDE8 117 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 ARPC1AQ92747 370 aa10.58□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 FCER1GP30273 86 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 ETDBQ3ZM63 59 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 Q5PR19 223 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.56□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV40A0A0B4J280 105 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GV72 72 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM8BA6NDV4 472 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 APC2O95996 2303 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 GFRALQ6UXV0 394 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP37Q8NFH4 326 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV1-47P01700 117 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF479Q96JC4 524 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLL5B9A064 214 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 J3QR89 54 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMM23O14925 209 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 DPM2O94777 84 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLC6P0CF74 106 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP5G2Q06055 141 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 CEACAM4O75871 244 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA3O95167 84 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 TRGV3P03979 118 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 PRAC2D3DTV9 90 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 EFNA4P52798 201 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 C12orf74Q32Q52 190 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 SFTA2Q6UW10 78 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 PRO0461Q9UI25 63 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 MED13LQ71F56 2210 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 PDE6HQ13956 83 aa10.5□□□□□ -0.73
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