RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, human

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PREB-208	ENST00000468045	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	ORM1	P02763	201 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	SCGB1A1	P11684	91 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	ZNF479	Q96JC4	524 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	LRBA	P50851	2863 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045		E9PLD3	99 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045		K7EM74	188 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	TNFRSF6B	O95407	300 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	PRR25	Q96S07	402 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	HIGD1B	Q9P298	99 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	SFTA2	Q6UW10	78 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	RELN	P78509	3460 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	NDUFA3	O95167	84 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	ERCC8	Q13216	396 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PREB-208	ENST00000468045		F8W1H4	67 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	DPM2	O94777	84 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	C20orf78	Q9BR46	151 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	HIST1H4G	Q99525	98 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	EFNA4	P52798	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	TRGV3	P03979	118 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	CEACAM4	O75871	244 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045		A0A1B0GWB2	263 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	IGHG4	P01861	327 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	RPE	Q96AT9	228 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	MRAP2	Q96G30	205 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	PRO0461	Q9UI25	63 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045		Q6ZQT7	251 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045		J3QR89	54 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	APC2	O95996	2303 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	TIMM23	O14925	209 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PREB-208	ENST00000468045	SPRY2	O43597	315 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	CFHR4	Q92496	578 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	RNF183	Q96D59	192 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PREB-208	ENST00000468045	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.82	□□□□□ -0.2

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