RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trank1Q8BV79 2999 aa14.81□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr284A0A0U1RP76 321 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Inafm1E9PV59 130 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dynlrb1P62627 96 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Neurog3P70661 214 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp386Q1WWJ5 626 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmprss3Q8K1T0 453 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q8VC23 124 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cds2Q99L43 444 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CenpmQ9CQA0 180 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 DysfQ9ESD7 2090 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cldn34c3J3QJW5 233 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cldn34c2J3QNM1 233 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PpoxP51175 477 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CxadrP97792 365 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q80VP5 184 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cldn34c1Q8K193 234 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 RfxapQ8VCG9 231 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Znf22Q9ERU3 237 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Arhgef17Q80U35 2057 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01787 123 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01796 113 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01797 113 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01799 113 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cdkn2aQ64364 169 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q6PIU9 354 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ifna16Q810G1 189 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Prb1Q91X93 504 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sfxn4Q925N1 313 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mettl8A2AUU0 281 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gfra3O35118 397 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wfdc8Q4KUS1 273 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vwc2Q8C8N3 324 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 VsirQ9D659 308 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr920E9Q413 310 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lbhd2G3UW55 114 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1537P34983 314 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Id3P41133 119 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc25a31Q3V132 320 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm11232Q5SPI8 295 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Morn2Q6UL01 79 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tusc5Q8C838 173 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pcgf1Q8R023 259 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr124Q8VGW6 315 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hs3st3b1Q9QZS6 390 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam3dP97805 223 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Taar5Q5QD14 337 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wasf3Q8VHI6 501 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Derl1Q99J56 251 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Barx1Q9ER42 254 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nav2E9Q842 2432 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kdf1A2A9F4 397 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm4791J3QQ14 102 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gnb1P62874 340 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q0VG49 157 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp936Q3ULA8 456 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Taar4Q5QD15 347 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fxyd3Q61835 88 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cxxc4Q6NXI8 198 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr859Q7TRF5 309 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ifna13Q80SU4 189 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 TslpQ9JIE6 140 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr624F8VQI7 308 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P18529 117 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vamp3P63024 103 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Klf14Q19A41 325 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PirtQ8BFY0 135 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cdcp2Q8BQH6 427 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r237Q8R296 289 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 2200002J24RikQ9D807 110 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tex43Q9D9I1 141 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cyb5r3Q9DCN2 301 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 LenepQ9WVB6 61 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Igkv6-23A0A140T8N5 115 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ifna4P07351 186 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Megf9Q8BH27 600 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc25a29Q8BL03 306 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr346Q8VGJ7 309 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa14.77□□□□□ -0.04
Ptpra-201ENSMUST00000028769 H3BKT1 185 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MyadmO35682 320 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 KncnQ307W7 124 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spock1Q62288 442 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zic3Q62521 466 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Timm21Q8CCM6 249 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Arl13aQ9D416 372 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Herpud1Q9JJK5 391 aa14.77□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr282A1L1B4 308 aa14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Adamts17E9Q4D1 1122 aa14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ca11O70354 328 aa14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr968Q8VFN4 314 aa14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bpifa5Q9CQX3 270 aa14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr918E9PVZ7 325 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms