RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 B4DSR2 109 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R2Z0 102 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CSN3P07498 182 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 RAB9AP51151 201 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 MUC21Q5SSG8 566 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ORM1P02763 201 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ARL3P36405 182 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 LCN12Q6JVE5 192 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC140Q96MF4 163 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF182Q8N6D2 247 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 VAMP8Q9BV40 100 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MWP6 167 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 VGLL1Q99990 258 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 TGFAP01135 160 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CENPEQ02224 2701 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM231BA6NCW3 169 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 M0QZ24 198 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ESDP10768 282 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 BLCAPP62952 87 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPN13Q12923 2485 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GXF2 115 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 BUB3O43684 328 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SH2D1AO60880 128 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ERCC8Q13216 396 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR25Q96S07 402 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 NIT1Q86X76 327 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 BMI1P35226 326 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CRIP1P50238 77 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PIFOQ8TCI5 191 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 DSCR9P59020 149 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 REC114Q7Z4M0 266 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 C16orf92Q96LL3 132 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM223BA6NKX1 122 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 C14orf144Q96I85 54 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PMCHL1Q16048 86 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 M0QZK8 103 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PAX1P15863 534 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CTAG1AP78358 180 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 PRAC2D3DTV9 90 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 HAX1O00165 279 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 AVPP01185 164 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 C3orf79P0CE67 100 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF138P52744 262 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 H0Y8G0 127 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 J3KRW8 73 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC25A16P16260 332 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 TDRG1Q3Y452 100 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6AWC8 147 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ATOH7Q8N100 152 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-208ENST00000510829 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TWIST1Q15672 202 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 USP24Q9UPU5 2620 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV12-3P01733 135 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KLK15Q9H2R5 256 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF114Q9Y508 228 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CREBBPQ92793 2442 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM213A2RRL7 107 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF738Q8NE65 137 aa8.51□□□□□ -1.05
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