RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490833.5

FN1-223, Transcript of fibronectin 1, human

TSL 3

Gene FN1, Length 699 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FN1-223	ENST00000490833	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	NDUFA4	O00483	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	OVOL1	O14753	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SPINK4	O60575	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	GNG5	P63218	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SLA	Q13239	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FOXE3	Q13461	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833		Q6ZWC4	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	PRR25	Q96S07	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833		K7EMT4	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	APELA	P0DMC3	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	NTF3	P20783	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	CDKN1A	P38936	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ID1	P41134	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SLC35B1	P78383	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833		U3KQK5	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SPTA1	P02549	2419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	IGHG2	P01859	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	MSMB	P08118	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	CTRL	P40313	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ZNF138	P52744	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ATP5J2	P56134	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	KLRD1	Q13241	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ZNF124	Q15973	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833		U3KQE9	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ROS1	P08922	2347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	TCF21	O43680	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	NUPR1	O60356	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ORM1	P02763	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	GNLY	P22749	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	GPR183	P32249	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	CKS2	P33552	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ARL3	P36405	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	GAGE1	Q13065	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	LY6D	Q14210	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	TWIST1	Q15672	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FN1-223	ENST00000490833	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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