RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 AMTP48728 403 aa6.87□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 HBBP68871 147 aa6.87□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.87□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 TXN2Q99757 166 aa6.87□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.87□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 30.5
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CDHR3-211ENST00000478080 GOSR1O95249 250 aa6.85□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 ATP5G2Q06055 141 aa6.85□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 TRGV3P03979 118 aa6.84□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.84□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 SH2D1AO60880 128 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-11P01762 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF138P52744 262 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.84□□□□□ -1.31
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CDHR3-211ENST00000478080 KLK15Q9H2R5 256 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 ZANQ9Y493 2812 aa6.84□□□□□ -1.31
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 CT45A10P0DMU9 189 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 HAX1O00165 279 aa6.83□□□□□ -1.32
CDHR3-211ENST00000478080 DLEU1O43261 78 aa6.83□□□□□ -1.32
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