RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 NFE4Q86UQ8 179 aa11.78□□□□□ -0.52
STX4-217ENST00000613541 PRR13Q9NZ81 148 aa11.78□□□□□ -0.52
STX4-217ENST00000613541 A0A087X0K7 114 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 GAGE12BA1L429 117 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 PITX3O75364 302 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 GAGE7O76087 117 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 IL5P05113 134 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 GAGE12FP0CL80 117 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 GAGE12GP0CL81 117 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 GAGE12IP0CL82 117 aa11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 RGS5O15539 181 aa11.76□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 CXCL2P19875 107 aa11.76□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 HOXA5P20719 270 aa11.76□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 SELENOTP62341 195 aa11.76□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 FAM229AH3BQW9 127 aa11.75□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 CTDSPLO15194 276 aa11.75□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.75□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 PRSS46E5RG02 174 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 SYNGR2O43760 224 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 OR5G3P0C626 314 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 PLP1P60201 277 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 C18orf15Q96N68 181 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 WRBO00258 174 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 IL18Q14116 193 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 ICAM4Q14773 271 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 LCN15Q6UWW0 184 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 CCDC190Q86UF4 302 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 MCUBQ9NWR8 336 aa11.73□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 A0A096LPF7 62 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 SMCO3A2RU48 225 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 LINC00869P0C866 280 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 LRTM2Q8N967 370 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.72□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 J3QL48 77 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 K7EP13 123 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 NXPH4O95158 308 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 LEPP41159 167 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.71□□□□□ -0.53
STX4-217ENST00000613541 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 CTF1Q16619 201 aa11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 C4orf46Q504U0 113 aa11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.7□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 A0A087WTM6 91 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 GCSHP23434 173 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 KRTAP10-1P60331 282 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 Q6ZSN1 163 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 Q6ZTI0 123 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ODF3Q96PU9 254 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.69□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 CTDSP2O14595 271 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 PAX4O43316 350 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 VAMP1P23763 118 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 SLAQ13239 276 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ARL6Q9H0F7 186 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ARV1Q9H2C2 271 aa11.68□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 KIR3DS1Q14943 382 aa11.67□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.67□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 FNDC10F2Z333 226 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 H3BP45 60 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 K7EPK0 472 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.544e-8■□□□□ 9.9
STX4-217ENST00000613541 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 PSENENQ9NZ42 101 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 MDFICQ9P1T7 246 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 FUT9Q9Y231 359 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.66□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms