RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 PF4P02776 101 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 I3L3M4 83 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF580Q9UK33 172 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PPI3 338 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C15orf32Q32M92 178 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LEPROTO15243 131 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 AZU1P20160 251 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 CD28P10747 220 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01587Q99440 93 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.72□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 OBSL1O75147 1896 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 F8VRH5 84 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 H3BVH4 76 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 P0C879 139 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 IGLC1P0CG04 106 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 IGLC2P0DOY2 106 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 IGLC3P0DOY3 106 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 EGR1P18146 543 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 HERVK_113P63121 156 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PRR25Q96S07 402 aa5.71□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 GGTLC3B5MD39 225 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 CD7P09564 240 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PIFOQ8TCI5 191 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 FXYD5Q96DB9 178 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01619G3V211 115 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 NDUFA3O95167 84 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 WIPF3A6NGB9 483 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 H7C423 109 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 BRI3O95415 125 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PLAUP00749 431 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 CRPP02741 224 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 HLA-DMBP28068 263 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.71□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TNFRSF6BO95407 300 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1-39P01597 117 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGHG4P01861 327 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1D-39P04432 117 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 VSIRQ9H7M9 311 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 COL4A3Q01955 1670 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0J9YXY3 114 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 D6R8Y8 96 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 MSMBP08118 114 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PYYP10082 97 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 SS18Q15532 418 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 CXCL5P42830 114 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF134P52741 427 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZRM9 215 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 K7EP34 96 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-7P01780 117 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PDE6GP18545 87 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 CTRLP40313 264 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 C14orf144Q96I85 54 aa5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WX48 190 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 E7EQL1 145 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 ZNHIT1O43257 154 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 GUSBP1Q15486 140 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01560Q8TB33 94 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 RCHY1Q96PM5 261 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 EVI2AP22794 236 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 ERCC8Q13216 396 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 AJUBAQ96IF1 538 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0G2JRQ6 117 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 A6NNC1 897 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 KLRD1Q13241 179 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 LEAP2Q969E1 77 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TIMM17AQ99595 171 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 PCP4P48539 62 aa5.69□□□□□ -1.5
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