RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410388.1

RNU6-1050P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1050, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1050P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ARL5AQ9Y689 179 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 AKAP6Q13023 2319 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 A0A0J9YY99 117 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CNIH1O95406 144 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 RAB5CP51148 216 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 RRN3P1Q2M238 152 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 XAF1Q6GPH4 301 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 S100A7AQ86SG5 101 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 OR5D16Q8NGK9 328 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 BORCS7Q96B45 105 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CADP27708 2225 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 RTL1A6NKG5 1358 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MYCBP2O75592 4640 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 C9orf170A2RU37 121 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 DEFA3P59666 94 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 HYLS1Q96M11 299 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 VPS29Q9UBQ0 182 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 FMN1Q68DA7 1419 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TNXBP22105 4242 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ABCA1O95477 2261 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 A0A096LPI6 279 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 SULT1C4O75897 302 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 SERPINA6P08185 405 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 IFITM1P13164 125 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 UBE2BP63146 152 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TMED1Q13445 227 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MALSU1Q96EH3 234 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 GLTPQ9NZD2 209 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 NUP98P52948 1817 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 FXYD1O00168 92 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 HLA-EP13747 358 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 EVI2AP22794 236 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 SERPINB9P50453 376 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PIGPP57054 158 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 LRRC18Q8N456 261 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 UQCC1Q9NVA1 299 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MED13LQ71F56 2210 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1050P-201ENST00000410388 FAM159BA6NKW6 160 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CLDN24A6NM45 220 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 IFNA16P05015 189 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 OMPP47874 163 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CCDC122Q5T0U0 273 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CLDN22Q8N7P3 220 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 NPCDR1Q9BY65 106 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 POPDC3Q9HBV1 291 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 KIF1BO60333 1816 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PIK3C2GO75747 1445 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 hDV103S1A0JD37 113 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TAX1BP3O14907 124 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 IGHV3-30P01768 117 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ZNF56Q15929 161 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 C5orf17Q8NAS9 161 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TEX37Q96LM6 180 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ESPL1Q14674 2120 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TRAV4A0A0B4J268 109 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 IFNA5P01569 189 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 DYNLT3P51808 116 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 LINC00208Q96KT6 92 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PDZD2O15018 2839 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 A0A087WUJ7 227 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ETV6P41212 452 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 OR4K15Q8NH41 348 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PPTC7Q8NI37 304 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 SPTBN2O15020 2390 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 UNC13BO14795 1591 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TANC1Q9C0D5 1861 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 PDE6DO43924 150 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 SPRR2DP22532 72 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 COX6A2Q02221 97 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 ZNF292O60281 2723 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1050P-201ENST00000410388 CEP164Q9UPV0 1460 aa-1.15□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms