RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 PRORYQ9H606 182 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CCL21O00585 134 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MORN5Q5VZ52 161 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LMO3Q8TAP4 145 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CREBBPQ92793 2442 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 COX14Q96I36 57 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CSTL1Q9H114 145 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 OOSP1A8MZH6 123 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 K7EP13 123 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-30P01768 117 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXF2Q12947 444 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TOMM6Q96B49 74 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TNS2Q63HR2 1409 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP5J2P56134 94 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZS49 121 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TEX37Q96LM6 180 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM88BA6NKF7 163 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MSMBP08118 114 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 DANCRP0C864 163 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SSC5DA1L4H1 1573 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.56□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PPM0 123 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV3-20P01619 116 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXQ1Q9C009 403 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PSG8Q9UQ74 426 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PEAK1Q9H792 1746 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 BCL9O00512 1426 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CD55P08174 381 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PFN2P35080 140 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXF1Q12946 379 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA0040Q15053 153 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00483Q53H64 154 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CCL4L1Q8NHW4 92 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 COX7B2Q8TF08 81 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 C20orf78Q9BR46 151 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 M0R1W7 72 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 GP9P14770 177 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CCL18P55774 89 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 GTSF1Q8WW33 167 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MYOM1P52179 1685 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 HIGD1CA8MV81 97 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 C5orf38Q86SI9 138 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CRIPTQ9P021 101 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-9P01782 118 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHMP01871 453 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CXCL2P19875 107 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SHPRHQ149N8 1683 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LIMS1P48059 325 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LY6EQ16553 131 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SPACA5Q96QH8 159 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 AMELYQ99218 206 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 REG4Q9BYZ8 158 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PMS2P5A8MQ11 134 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CFHR3Q02985 330 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 Q0VG73 95 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 HCP5Q6MZN7 132 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF318Q5VUA4 2279 aa2.55□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM231BA6NCW3 169 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 DKK1O94907 266 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLL1P15814 213 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PCOLCEQ15113 449 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 C3orf36Q3SXR2 165 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 P0DMU3 169 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM231AP0DMU4 169 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM231CP0DMU5 169 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CDPF1Q6NVV7 123 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF702PQ9H963 129 aa2.54□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms