RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PLP1	P60201	277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	GNB1	P62873	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RUNX1	Q01196	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TRGV9	Q99603	122 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ASCL2	Q99929	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CITED1	Q99966	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PS18	150 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CHEK1	O14757	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	AGPAT2	O15120	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CNIH1	O95406	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PRH1	P02810	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNA4	P05014	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CRYBA1	P05813	215 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	APELA	P0DMC3	54 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	FGF7	P21781	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SNCA	P37840	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB5C	P51148	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TXN2	Q99757	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNA5	P01569	189 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CTSG	P08311	255 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5G3	P0C626	314 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	FHIT	P49789	147 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RND2	P52198	227 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717		F8WDY8	70 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	CCL24	O00175	119 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2J3	O76001	311 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	M6PR	P20645	277 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10J1	P30954	320 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB2A	P61019	212 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	SELENOT	P62341	195 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	RHOG	P84095	191 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFA5	Q01523	94 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF90	Q03938	601 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72

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