RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		17.51	■□□□□ 0.39
DCTN1-222	ENST00000492717	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
DCTN1-222	ENST00000492717	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
DCTN1-222	ENST00000492717	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		14.57	□□□□□ -0.08
DCTN1-222	ENST00000492717	ADRA2B	P18089	450 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DCTN1-222	ENST00000492717	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXD1	Q16676	465 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNA4	P22459	653 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DCTN1-222	ENST00000492717	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DCTN1-222	ENST00000492717	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DCTN1-222	ENST00000492717	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DCTN1-222	ENST00000492717	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DCTN1-222	ENST00000492717	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
DCTN1-222	ENST00000492717	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
DCTN1-222	ENST00000492717	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DCTN1-222	ENST00000492717	MSH5	O43196	834 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DCTN1-222	ENST00000492717	ZBTB22	O15209	634 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12.1	□□□□□ -0.47
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DCTN1-222	ENST00000492717	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
DCTN1-222	ENST00000492717	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DCTN1-222	ENST00000492717	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ABCC9	O60706	1549 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DCTN1-222	ENST00000492717	FKBP8	Q14318	412 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DCTN1-222	ENST00000492717	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DCTN1-222	ENST00000492717	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DCTN1-222	ENST00000492717	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DCTN1-222	ENST00000492717	NACAD	O15069	1562 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DCTN1-222	ENST00000492717	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DCTN1-222	ENST00000492717	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DCTN1-222	ENST00000492717		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DCTN1-222	ENST00000492717	APLP2	Q06481	763 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DCTN1-222	ENST00000492717	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11	□□□□□ -0.65
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DCTN1-222	ENST00000492717	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DCTN1-222	ENST00000492717	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DCTN1-222	ENST00000492717	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DCTN1-222	ENST00000492717	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DCTN1-222	ENST00000492717	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	10.83	□□□□□ -0.68
DCTN1-222	ENST00000492717	FBLN2	P98095	1184 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DCTN1-222	ENST00000492717	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DCTN1-222	ENST00000492717	SCRIB	Q14160	1630 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DCTN1-222	ENST00000492717	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DCTN1-222	ENST00000492717	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
DCTN1-222	ENST00000492717	PROM2	Q8N271	834 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DCTN1-222	ENST00000492717	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DCTN1-222	ENST00000492717	POLA2	Q14181	598 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPN15	O75808	1086 aa		10.57	□□□□□ -0.72
DCTN1-222	ENST00000492717	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		10.55	□□□□□ -0.72
DCTN1-222	ENST00000492717	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
DCTN1-222	ENST00000492717	PKD2	Q13563	968 aa		10.5	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.5	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DCTN1-222	ENST00000492717	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DCTN1-222	ENST00000492717	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
DCTN1-222	ENST00000492717	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	SMARCA4	P51532	1647 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	ABCB7	O75027	752 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	NCAPD3	P42695	1498 aa		10.35	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		10.34	□□□□□ -0.75
DCTN1-222	ENST00000492717	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	MIER1	Q8N108	512 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	SPDYE6	P0CI01	402 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DCTN1-222	ENST00000492717	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.29	□□□□□ -0.76

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