RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000207178.1

Lmo1-202, Transcript of Rhombotin-1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene Lmo1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr1137Q7TR40 310 aa14.62□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm9949Q8C9F4 104 aa14.62□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Klre1Q8CJC7 226 aa14.62□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 RpeQ8VEE0 228 aa14.62□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 9330161L09RikQ9D253 136 aa14.62□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Klf13Q9JJZ6 289 aa14.62□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ighv6-6A0A075B5T3 119 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 A0A286YDU1 74 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr1511E9PWU0 318 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr177E9Q7W1 309 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm3327F7C9A1 213 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm8229K7N749 213 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Amy1P00687 511 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 GferP56213 198 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Vmn1r15Q14C10 299 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Adgrg5Q3V3Z3 524 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Npy4rQ61041 375 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Glt8d1Q6NSU3 371 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Smco1Q8CEZ1 214 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lrrtm1Q8K377 522 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr1259Q8VEZ1 309 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 H2bfmQ9DAB5 224 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr243E9PV96 316 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Slc6a9P28571 692 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rab3ipQ68EF0 428 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Minos1Q7TNS2 76 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gemin8Q8BHE1 238 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nob1Q8BW10 403 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tmem17Q8K0U3 198 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr164Q8VF87 315 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Eef1akmt1Q9CY45 214 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Upk3bl1Q9D701 249 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Phb2O35129 299 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ctxn2Q3URE8 81 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mef2aQ60929 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Foxc2Q61850 494 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nars2Q8BGV0 477 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tsen54Q8C2A2 525 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 MetrnlQ8VE43 311 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nudcd2Q9CQ48 157 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 NepnQ9CQ76 512 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Prr15Q9D1T5 122 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Wdr4Q9EP82 413 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmo1-202ENSMUST00000207178 S100zB9EJL3 99 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr196E9PYP4 309 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mtatp6P00848 226 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fcer1gP20491 86 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Chrna7P49582 502 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cdx4Q07424 282 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Harbi1Q8BR93 349 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lsm11Q8BUV6 361 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr790Q8VGJ3 322 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa14.58□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Zfp972A2AW65 139 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm21800J3QMJ9 180 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Vmn1r78K7N608 313 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cnih2O35089 160 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ren2P00796 401 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mamld1P0C6A2 803 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ubald1Q6P3B2 176 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Upk3bQ80YF6 275 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm9758Q80ZT2 255 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Comtd1Q8BIG7 262 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cacng6Q8VHW3 260 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Acaa1aQ921H8 424 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ap5s1Q9D742 170 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Spcs1Q9D958 161 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa14.57□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm17660B9UIU9 90 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gfi1bO70237 330 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cd83O88324 196 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 P01658 132 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rpl30P62889 115 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gng2P63213 71 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ang6Q5GAN0 147 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tm2d3Q8BJ83 261 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr837Q8VFJ4 312 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Olfr1297Q8VGE8 312 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gpx6Q91WR8 221 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hspb11Q9D6H2 143 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pard6gQ9JK84 382 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Sumo3Q9Z172 110 aa14.56□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Trav18A0A075B656 109 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lcn5A2AJB7 192 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm10553J3QPF1 123 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rnf5O35445 180 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 H2-DMb1P35737 261 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hsf1P38532 525 aa14.55□□□□□ -0.08
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Q3U595 105 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms