Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEZ1

Smco1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco1Q8CEZ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Smco1Q8CEZ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Smco1Q8CEZ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Smco1Q8CEZ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Smco1Q8CEZ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Smco1Q8CEZ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Smco1Q8CEZ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Smco1Q8CEZ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Smco1Q8CEZ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Smco1Q8CEZ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Smco1Q8CEZ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Smco1Q8CEZ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Smco1Q8CEZ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Smco1Q8CEZ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Smco1Q8CEZ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Smco1Q8CEZ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Smco1Q8CEZ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Smco1Q8CEZ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Smco1Q8CEZ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Smco1Q8CEZ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Smco1Q8CEZ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Smco1Q8CEZ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Smco1Q8CEZ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Smco1Q8CEZ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Smco1Q8CEZ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Smco1Q8CEZ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Smco1Q8CEZ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Smco1Q8CEZ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Smco1Q8CEZ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Smco1Q8CEZ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Smco1Q8CEZ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Smco1Q8CEZ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Smco1Q8CEZ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Smco1Q8CEZ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Smco1Q8CEZ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Smco1Q8CEZ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Smco1Q8CEZ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Smco1Q8CEZ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Smco1Q8CEZ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Smco1Q8CEZ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Smco1Q8CEZ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Smco1Q8CEZ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Smco1Q8CEZ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Smco1Q8CEZ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Smco1Q8CEZ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Smco1Q8CEZ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Smco1Q8CEZ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Smco1Q8CEZ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Smco1Q8CEZ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Smco1Q8CEZ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Smco1Q8CEZ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Smco1Q8CEZ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smco1Q8CEZ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smco1Q8CEZ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smco1Q8CEZ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smco1Q8CEZ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Smco1Q8CEZ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Smco1Q8CEZ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Smco1Q8CEZ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Smco1Q8CEZ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Smco1Q8CEZ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Smco1Q8CEZ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Smco1Q8CEZ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Smco1Q8CEZ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Smco1Q8CEZ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Smco1Q8CEZ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Smco1Q8CEZ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Smco1Q8CEZ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Smco1Q8CEZ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Smco1Q8CEZ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Smco1Q8CEZ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Smco1Q8CEZ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Smco1Q8CEZ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Smco1Q8CEZ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Smco1Q8CEZ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Smco1Q8CEZ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Smco1Q8CEZ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Smco1Q8CEZ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Smco1Q8CEZ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Smco1Q8CEZ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Smco1Q8CEZ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Smco1Q8CEZ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Smco1Q8CEZ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Smco1Q8CEZ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Smco1Q8CEZ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Smco1Q8CEZ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Smco1Q8CEZ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Smco1Q8CEZ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Smco1Q8CEZ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Smco1Q8CEZ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Smco1Q8CEZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Smco1Q8CEZ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Smco1Q8CEZ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Smco1Q8CEZ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Smco1Q8CEZ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Smco1Q8CEZ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Smco1Q8CEZ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Smco1Q8CEZ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Smco1Q8CEZ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Smco1Q8CEZ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
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