RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FMS1	P50264	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SPO77	Q06134	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GMC2	Q06201	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YEH2	Q07950	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TAH18	Q12181	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MED1	Q12321	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BNR1	P40450	1375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BI4	P03879	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SRS2	P12954	1174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GRR1	P24814	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CLB3	P24870	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FUN30	P31380	1131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ATO2	P32907	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	OSH7	P38755	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SEN34	P39707	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ALG5	P40350	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NMA111	P53920	997 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MET14	Q02196	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RSM24	Q03976	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PDR8	Q06149	701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	IML1	P47170	1584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TRP3	P00937	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RAS1	P01119	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	IDI1	P15496	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	HMX1	P32339	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MRPL10	P36520	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TDA11	P38854	504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CCT6	P39079	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VPS70	P47161	811 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	REC102	Q02721	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VPS74	Q06385	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SRN2	Q99176	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LYS2	P07702	1392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SFI1	YLL003W	CHS3	P29465	1165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	HIR1	P32479	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	VAM7	P32912	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MKS1	P34072	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YUH1	P35127	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	APM3	P38153	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SWC5	P38326	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SAW1	P39735	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YER184C	P39961	794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	VAC8	P39968	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	VTH1	P40438	1549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SLM1	P40485	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	VTH2	P40890	1549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	ELP2	P42935	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	POL32	P47110	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SOL4	P53315	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SPR28	Q04921	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	UIP4	Q08926	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MMP1	Q12372	583 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	HMS1	Q12398	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RAD57	P25301	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	DPH2	P32461	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MYO3	P36006	1272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SFI1	YLL003W	TDP1	P38319	544 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BSD2	P38356	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YIL077C	P40508	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	THI11	P47183	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MAL11	P53048	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	TFB2	Q02939	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BCH1	Q05029	724 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YFT2	Q06676	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	APM4	Q99186	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SRM1	P21827	482 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	IMP2'	P32351	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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