RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	CRC1	Q12289	327 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ZPS1	Q12512	249 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CDC23	P16522	626 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YCR043C	P25361	127 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RPC34	P32910	317 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HXT7	P39004	570 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	LRO1	P40345	661 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SPO1	P53541	631 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	BUD17	P53727	317 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NTH1	P32356	751 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MAL31	P38156	614 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	EFM2	P38347	419 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YND1	P40009	630 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MGS1	P40151	587 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YIL024C	P40543	189 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HUL4	P40985	892 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NPY1	P53164	384 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	COX18	P53239	316 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NSE3	Q05541	303 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HER1	Q12276	1246 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	APN2	P38207	520 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TIM54	P47045	478 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ACS1	Q01574	713 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	AAT1	Q01802	451 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RAD33	Q04231	177 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	COG8	Q04632	607 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RAD34	Q06665	692 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	OSH2	Q12451	1283 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	LTE1	P07866	1435 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	DNF2	Q12675	1612 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	WHI2	P12611	486 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	FLO5	P38894	1075 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CDC1	P40986	491 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	THI6	P41835	540 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YFL052W	P43551	465 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ZAP1	P47043	880 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	AIM14	P53109	570 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MLH2	Q07980	695 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	KIN82	P25341	720 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MSH2	P25847	964 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TIM23	P32897	222 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	LEU5	P38702	357 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RIM4	P38741	713 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PIH1	P38768	344 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	VPS41	P38959	992 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PRM2	P40534	656 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CIN1	P40987	1014 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YGL260W	P53056	76 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	VTC3	Q02725	835 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TRS23	Q03784	219 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ENT2	Q05785	613 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SNA4	Q07549	140 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	APM4	Q99186	491 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	EHT1	P38295	451 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ERV46	P39727	415 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YJL043W	P47053	257 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NSE5	Q03718	556 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CYK3	Q07533	885 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	AAC1	P04710	309 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SFL1	P20134	766 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	AMD2	P22580	549 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RTT107	P38850	1070 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TMN3	P40071	706 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MET13	P53128	600 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	UGO1	Q03327	502 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YMR317W	Q04893	1140 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	VHS3	Q08438	674 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NRT1	Q08485	598 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ATX2	Q12067	313 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CDC5	P32562	705 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YBR139W	P38109	508 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	FAT1	P38225	669 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SKP2	P42843	763 aa		0.78	□□□□□ -2.28

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