RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 RXRAP19793 462 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SHTN1A0MZ66 631 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 DNA2P51530 1060 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ANO1Q5XXA6 986 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CHD1O14646 1710 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TET3O43151 1660 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBB4BP68371 445 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ZAP70P43403 619 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC175P0C221 793 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CPA1P15085 419 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 KDM6BO15054 1643 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 SV2BQ7L1I2 683 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 JAG2Q9Y219 1238 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRVP-205ENST00000641549 PHACTR2O75167 634 aa15.21■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TACC1O75410 805 aa15.21■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TAF5LO75529 589 aa15.21■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CUTAO60888 179 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MYL5Q02045 173 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ABCC3O15438 1527 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KRT86O43790 486 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GOPCQ9HD26 462 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DYNC1I1O14576 645 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNQ3O43525 872 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ACTN2P35609 894 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NEK11Q8NG66 645 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
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PTPRVP-205ENST00000641549 LETM2Q2VYF4 491 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SPECC1Q5M775 1068 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR108Q9NPR9 543 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 COPRSQ9NQ92 184 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KIF5AQ12840 1032 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PLS1Q14651 629 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC42Q96M95 316 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CTAGE8P0CG41 777 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF174Q15697 407 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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PTPRVP-205ENST00000641549 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 UBXN1Q04323 297 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PICK1Q9NRD5 415 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 E7EWF7 191 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 HAUS7Q99871 368 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1B0GVL5 298 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CIAO1O76071 339 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CEP112Q8N8E3 955 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TMX1Q9H3N1 280 aa15.16■□□□□ 0.02
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