RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	KANK3	Q6NY19	840 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PLD4	Q96BZ4	506 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		6.71	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	USP31	Q70CQ4	1352 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	IRS1	P35568	1242 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP11A	P98196	1134 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC9	Q92623	222 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		6.7	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA3	Q08378	1498 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PP55	124 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	NFKBIE	O00221	500 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPA1	O75762	1119 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PMM1	Q92871	262 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	OSMR	Q99650	979 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PBX4	Q9BYU1	374 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CHD1	O14646	1710 aa		6.69	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R082	166 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PI16	Q6UXB8	463 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SPG7	Q9UQ90	795 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP135	Q66GS9	1140 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	HHIP	Q96QV1	700 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	COPRS	Q9NQ92	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SNTG2	Q9NY99	539 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	LILRB5	O75023	590 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	DGKG	P49619	791 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIK5	Q16478	980 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP170	Q5SW79	1584 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SMC5	Q8IY18	1101 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	NXPE3	Q969Y0	559 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	RRAGC	Q9HB90	399 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF4	O43474	513 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	RASA3	Q14644	834 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	EHD4	Q9H223	541 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf49	Q9H741	205 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		6.66	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ETFB	P38117	255 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX4	P57082	545 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	GRM2	Q14416	872 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNJL	Q8IV13	435 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	TCF12	Q99081	682 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		6.65	□□□□□ -1.34
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC45	O75419	566 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35

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