RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 IDH1O75874 414 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF202O95125 648 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STARD3NLO95772 234 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 UBE3CQ15386 1083 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CPLX1O14810 134 aa15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PTPAQ15257 358 aa15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MYL10Q9BUA6 226 aa15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LY9Q9HBG7 655 aa15.52■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BIN1O00499 593 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 VPS37DQ86XT2 251 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MAP3K14Q99558 947 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SDF4Q9BRK5 362 aa15.52■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SMTNL1A8MU46 457 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ALG1Q9BT22 464 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLC39A14Q15043 492 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KRT40Q6A162 431 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SHC4Q6S5L8 630 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 HPSEQ9Y251 543 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SKILP12757 684 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CMA1P23946 247 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MICU3Q86XE3 530 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 BTG4Q9NY30 223 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GUL6 1792 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PDE8AO60658 829 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RASGRF1Q13972 1273 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NLRP12P59046 1061 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 LAMB2P55268 1798 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CASZ1Q86V15 1759 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 APPP05067 770 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ISM2Q6H9L7 571 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RGS22Q8NE09 1264 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CLIC6Q96NY7 704 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RREB1Q92766 1687 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NEMFO60524 1076 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GUCY1A2P33402 732 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CEP135Q66GS9 1140 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KCND1Q9NSA2 647 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IFNKQ9P0W0 207 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PRKAB2O43741 272 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TRDNQ13061 729 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA5Q8NB90 893 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 LPIN2Q92539 896 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NID2Q14112 1375 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MBD4O95243 580 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ALX1Q15699 326 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ARMT1Q9H993 441 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ATP1A3P13637 1013 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PPP6R2O75170 966 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PNOCQ13519 176 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RESP18Q5W5W9 173 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM87BQ96K49 555 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms