RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 ABCC6O95255 1503 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRRC37A3O60309 1634 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 TLR1Q15399 786 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF4Q96M43 638 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 LTN1O94822 1766 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 EML1O00423 815 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLSCR1O15162 318 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 NFE2L2Q16236 605 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 RTN1Q16799 776 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 PI16Q6UXB8 463 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 C12orf49Q9H741 205 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 RTL1A6NKG5 1358 aa9.52□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 FLT4P35916 1363 aa9.52□□□□□ -0.88
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP54Q70EL1 1684 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 LILRA1O75019 489 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 NOS2P35228 1153 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 GJA8P48165 433 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 TXNRD1Q16881 649 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 TREML1Q86YW5 311 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPRASP2Q96D09 838 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 XAGE2Q96GT9 111 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 STK32BQ9NY57 414 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 INSRP06213 1382 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 ST18O60284 1047 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 IL2RAP01589 272 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEAD4Q15561 434 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 MORC1Q86VD1 984 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNB2Q92953 911 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 HSD3B2P26439 372 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 IRS1P35568 1242 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 CNKSR1Q969H4 720 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 IL21Q9HBE4 155 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 COPRSQ9NQ92 184 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 BCL9O00512 1426 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 GIPC1O14908 333 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 GRM5P41594 1212 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANAPC15P60006 121 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 SKOR1P84550 965 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM32Q13049 653 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF15Q8N660 670 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 POLKQ9UBT6 870 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 PEAK1Q9H792 1746 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 POTEB3A0JP26 581 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP17L7P0C7H9 530 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 POTEBQ6S5H4 581 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 MEGF6O75095 1541 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNQ4P56696 695 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 WNT7BP56706 349 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDK15Q96Q40 435 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 RREB1Q92766 1687 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4DIP-241ENST00000616206 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
PDE4DIP-241ENST00000616206 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms