RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580022.5

TSPOAP1-AS1-205, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,337 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RAI14Q9P0K7 980 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C4AP0C0L4 1744 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CYP7A1P22680 504 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KLRK1P26718 216 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ADGRA1Q86SQ6 560 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZMYM6O95789 1325 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TDO2P48775 406 aa28.26■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MPNDQ8N594 471 aa28.26■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 USP25Q9UHP3 1055 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DYNC1I1O14576 645 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GNAT2P19087 354 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MAP7D2Q96T17 732 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CHD4Q14839 1912 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CPLX1O14810 134 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SENP2Q9HC62 589 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LIG1P18858 919 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RXRAP19793 462 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PKNOX2Q96KN3 472 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KDM4AO75164 1064 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MYH15Q9Y2K3 1946 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TM4SF1P30408 202 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CFAP45Q9UL16 551 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ADCY5O95622 1261 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NFIXQ14938 502 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TMEM87BQ96K49 555 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PGBD1Q96JS3 809 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TOMM22Q9NS69 142 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 APOA5Q6Q788 366 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MICU3Q86XE3 530 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CACNA1SQ13698 1873 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C8orf76Q96K31 380 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LY9Q9HBG7 655 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SLC51AQ86UW1 340 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BICD2Q8TD16 824 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MYL10Q9BUA6 226 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CAMK4Q16566 473 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KRT23Q9C075 422 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DACT1Q9NYF0 836 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CNBD1Q8NA66 436 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZNF384Q8TF68 577 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 USP28Q96RU2 1077 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZBTB43O43298 467 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CDC27P30260 824 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms