RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556240.1

GPHN-212, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 404 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-212ENST00000556240 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.54□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.54□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.54□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 CYP11A1P05108 521 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 ADH5P11766 374 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 ADMP35318 185 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 ITGAEP38570 1179 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 COL19A1Q14993 1142 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 ZAR1Q86SH2 424 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 BCL11AQ9H165 835 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 SPG7Q9UQ90 795 aa6.53□□□□□ -1.36
GPHN-212ENST00000556240 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CYP26A1O43174 497 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ERCC3P19447 782 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 MAOBP27338 520 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 GRIA4P48058 902 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CCDC27Q2M243 656 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 FRMD6Q96NE9 622 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.52□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 FAM170BA6NMN3 283 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 PRNPP04156 253 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CTSBP07858 339 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 RAB6AP20340 208 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ITPKAP23677 461 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 FCGRTP55899 365 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 GRM2Q14416 872 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 POU4F3Q15319 338 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 FBXL18Q96ME1 805 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CORO1BQ9BR76 489 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 BCO2Q9BYV7 579 aa6.51□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 NFICP08651 508 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 GSTT1P30711 240 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 AP3B2Q13367 1082 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 DYMQ7RTS9 669 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ZNF576Q9H609 170 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ABCB6Q9NP58 842 aa6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 B3GALT4O96024 378 aa6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 MAP7Q14244 749 aa6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 GATA6Q92908 595 aa6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 RAD18Q9NS91 495 aa6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.49□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 FLCNQ8NFG4 579 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CEP44Q9C0F1 390 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 SAMM50Q9Y512 469 aa6.48□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ECEL1O95672 775 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CYP27A1Q02318 531 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 CBLL1Q75N03 491 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.47□□□□□ -1.37
GPHN-212ENST00000556240 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 ASPAP45381 313 aa6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 PDE3AQ14432 1141 aa6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 PI16Q6UXB8 463 aa6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 GNA15P30679 374 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 C12orf49Q9H741 205 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 AOC2O75106 756 aa6.44□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.44□□□□□ -1.38
GPHN-212ENST00000556240 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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