RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	SHISA5	Q8N114	240 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	TGFB1	P01137	390 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	RAB6A	P20340	208 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	GIPC1	O14908	333 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	GSC2	O15499	205 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	NME2	P22392	152 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	RXRB	P28702	533 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	LRP8	Q14114	963 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	DYM	Q7RTS9	669 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	GATA6	Q92908	595 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	MED26	O95402	600 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ARNT	P27540	789 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	ADM	P35318	185 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	USP11	P51784	963 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM23-208	ENST00000553876	F13B	P05160	661 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	NFIC	P08651	508 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	BMP6	P22004	513 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	CD97	P48960	835 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	KCNB2	Q92953	911 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	NEFM	P07197	916 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	ASPA	P45381	313 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	ID3	Q02535	119 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	ERCC3	P19447	782 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	SSTR4	P31391	388 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	CTSH	P09668	335 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	NTF4	P34130	210 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	DAB2	P98082	770 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	PAOX	Q6QHF9	649 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	CBX8	Q9HC52	389 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RBM23-208	ENST00000553876	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.1	□□□□□ -1.27

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