RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 MCAMP43121 646 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 MECOMQ03112 1051 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 VGLL4Q14135 290 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 UBE4AQ14139 1066 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CYP7A1P22680 504 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CCL15Q16663 113 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 KDM4AO75164 1064 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 SPP2Q13103 211 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 TMC4Q7Z404 712 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CHMP4BP1P59074 171 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CAP1Q01518 475 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CRBNQ96SW2 442 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 PRKAB2O43741 272 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 GJA5P36382 358 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 USP5P45974 858 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 TEX11Q8IYF3 940 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 PTPRCP08575 1304 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 KIF16BQ96L93 1317 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RASSF10A6NK89 507 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 SPATA5Q8NB90 893 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 LNPKQ9C0E8 428 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CRHR2Q13324 411 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PTPN18Q99952 460 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 INCENPQ9NQS7 918 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CYP2D6P10635 497 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 DTNBO60941 627 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 HMGCS2P54868 508 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PLS1Q14651 629 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RILPL2Q969X0 211 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FEZ1Q99689 392 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MED23Q9ULK4 1368 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ELNP15502 786 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 TNNI3KQ59H18 835 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ARMT1Q9H993 441 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 C5orf42Q9H799 3197 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CCDC102AQ96A19 550 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CEP85Q6P2H3 762 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms