RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 BTDP43251 543 aa28.24■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.24■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 APPBP2Q92624 585 aa28.24■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 HIP1O00291 1037 aa28.23■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 MYO1BO43795 1136 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 CERS3Q8IU89 383 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 OSBP2Q969R2 916 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 PLCG2P16885 1265 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 RHBDL3P58872 404 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 USP40Q9NVE5 1235 aa28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-212ENST00000488787 CHMLP26374 656 aa28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.2■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.19■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM227BQ96M60 508 aa28.18■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 CLRN2A0PK11 232 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 KIF3CO14782 793 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 AIDAQ96BJ3 306 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.17■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 A0A0D9SFI3 127 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 M0R2C6 588 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 MBD4O95243 580 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 LDHDQ86WU2 507 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 LCORLQ8N3X6 602 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 ARMT1Q9H993 441 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 GGA3Q9NZ52 723 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 POTEIP0CG38 1075 aa28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 POTEJP0CG39 1038 aa28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 TEX11Q8IYF3 940 aa28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 IDI2Q9BXS1 227 aa28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 VEZTQ9HBM0 779 aa28.14■■■□□ 2.1
GTPBP1-212ENST00000488787 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 GPAA1O43292 621 aa28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CDC45O75419 566 aa28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CACNB3P54284 484 aa28.12■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 NFIAQ12857 509 aa28.11■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.11■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 ENTPD3O75355 529 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 GNAT2P19087 354 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 TNFAIP1Q13829 316 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM83AQ86UY5 434 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 RAD50Q92878 1312 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.1■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 PRKAB2O43741 272 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 TNNI2P48788 182 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CASC1Q6TDU7 716 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CNTNAP1P78357 1384 aa28.09■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 USP5P45974 858 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CHADLQ6NUI6 762 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 SULF1Q8IWU6 871 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM151AQ8WW52 585 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 FOCADQ5VW36 1801 aa28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GTPBP1-212ENST00000488787 SGSM2O43147 1006 aa28.07■■■□□ 2.08
GTPBP1-212ENST00000488787 RASA3Q14644 834 aa28.07■■■□□ 2.08
GTPBP1-212ENST00000488787 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GTPBP1-212ENST00000488787 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.07■■■□□ 2.08
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