RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	PPP4C	P60510	307 aa		29.48	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		29.48	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	CNTROB	Q8N137	903 aa		29.48	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	FSD1	Q9BTV5	496 aa		29.48	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		29.47	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		29.47	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	BAG3	O95817	575 aa		29.47	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		29.47	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	SKAP1	Q86WV1	359 aa		29.47	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	CLRN2	A0PK11	232 aa		29.46	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		29.46	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	USP40	Q9NVE5	1235 aa		29.46	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.45	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	CERS3	Q8IU89	383 aa		29.45	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
KCNS3-205	ENST00000481414	PLCG2	P16885	1265 aa		29.44	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	RHBDL3	P58872	404 aa		29.44	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		29.44	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	RILPL2	Q969X0	211 aa		29.44	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	29.44	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.44	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	RGS3	P49796	1198 aa		29.43	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	SULF1	Q8IWU6	871 aa		29.43	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	VEZT	Q9HBM0	779 aa		29.43	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		29.42	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	CHGB	P05060	677 aa		29.42	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	FSTL1	Q12841	308 aa		29.42	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		29.42	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	SDS	P20132	328 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	APPBP2	Q92624	585 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		29.41	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		29.4	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	USP48	Q86UV5	1035 aa		29.4	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	IDI2	Q9BXS1	227 aa		29.4	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	MYH7	P12883	1935 aa		29.39	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.39	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		29.39	■■■□□ 2.3
KCNS3-205	ENST00000481414	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	TNNI2	P48788	182 aa		29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	CACNB3	P54284	484 aa		29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	OSBP2	Q969R2	916 aa		29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		29.38	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	NFIA	Q12857	509 aa		29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	RASA3	Q14644	834 aa		29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	TEX11	Q8IYF3	940 aa		29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	ADM5	C9JUS6	153 aa		29.36	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		29.36	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	HIP1	O00291	1037 aa		29.35	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	ENTPD3	O75355	529 aa		29.35	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	AIDA	Q96BJ3	306 aa		29.35	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	CNTNAP1	P78357	1384 aa		29.35	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	MBD4	O95243	580 aa		29.34	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	LCORL	Q8N3X6	602 aa		29.34	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM151A	Q8WW52	585 aa		29.34	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	ARMT1	Q9H993	441 aa		29.33	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		29.33	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	PASK	Q96RG2	1323 aa		29.33	■■■□□ 2.29
KCNS3-205	ENST00000481414	TRAF5	O00463	557 aa		29.32	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		29.32	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	TCP10	Q12799	353 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	DLK2	Q6UY11	383 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	CDCA5	Q96FF9	252 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM227B	Q96M60	508 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	TEPSIN	Q96N21	525 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414		M0R2C6	588 aa		29.3	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	PICALM	Q13492	652 aa		29.3	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		29.3	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	AK9	Q5TCS8	1911 aa		29.3	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A0D9SFI3	127 aa		29.29	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	GPAA1	O43292	621 aa		29.29	■■■□□ 2.28
KCNS3-205	ENST00000481414	USP5	P45974	858 aa		29.29	■■■□□ 2.28

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