RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 NOS2P35228 1153 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 HINFPQ9BQA5 517 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.4□□□□□ -1.38
CNN3-204ENST00000461018 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.4□□□□□ -1.38
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CNN3-204ENST00000461018 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.39□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 TEAD4Q15561 434 aa6.38□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 NLRP8Q86W28 1048 aa6.38□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 BTBD6Q96KE9 485 aa6.38□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.38□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.38□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.38□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.37□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.37□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 GLTPD2A6NH11 291 aa6.37□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 CD33P20138 364 aa6.37□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 SEC13P55735 322 aa6.37□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 TGFB2P61812 414 aa6.37□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 DOC2BQ14184 412 aa6.37□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.37□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 DPYDQ12882 1025 aa6.36□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.36□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 PASKQ96RG2 1323 aa6.35□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.35□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.35□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 EML1O00423 815 aa6.35□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 CHRNA5P30532 468 aa6.35□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.35□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 USP17L24Q0WX57 530 aa6.34□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 LCE3BQ5TA77 95 aa6.34□□□□□ -1.39
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CNN3-204ENST00000461018 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.34□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.34□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.34□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.34□□□□□ -1.39
CNN3-204ENST00000461018 NFAT5O94916 1531 aa6.34□□□□□ -1.39
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