RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GSTO1	P78417	241 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLF2	Q8IX21	1173 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CACNB3	P54284	484 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LDHC	P07864	332 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BTD	P43251	543 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		27.95	■■■□□ 2.07
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CYP7A1	P22680	504 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.95	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RGS3	P49796	1198 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PDE6A	P16499	860 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EVI5L	Q96CN4	794 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CHGB	P05060	677 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RHBDL3	P58872	404 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NFIA	Q12857	509 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RASA3	Q14644	834 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FSD1	Q9BTV5	496 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADD2	P35612	726 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	APLP1	P51693	650 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CST9	Q5W186	159 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SKAP1	Q86WV1	359 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HSPA6	P17066	643 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPP4C	P60510	307 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TICAM2	Q86XR7	235 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BAG3	O95817	575 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TNNI2	P48788	182 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HTRA3	P83110	453 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TCP10	Q12799	353 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TEPSIN	Q96N21	525 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM83A	Q86UY5	434 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PICALM	Q13492	652 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PLCG2	P16885	1265 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SDS	P20132	328 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HIP1	O00291	1037 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ENTPD3	O75355	529 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FZD1	Q9UP38	647 aa		27.8	■■■□□ 2.04

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