RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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GPC1-202ENST00000420138 EVCP57679 992 aa24.78■■□□□ 1.56
GPC1-202ENST00000420138 GTF3C6Q969F1 213 aa24.78■■□□□ 1.56
GPC1-202ENST00000420138 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.78■■□□□ 1.56
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GPC1-202ENST00000420138 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.72■■□□□ 1.55
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GPC1-202ENST00000420138 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.7■■□□□ 1.55
GPC1-202ENST00000420138 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.7■■□□□ 1.55
GPC1-202ENST00000420138 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.7■■□□□ 1.55
GPC1-202ENST00000420138 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.7■■□□□ 1.55
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GPC1-202ENST00000420138 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.7■■□□□ 1.54
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GPC1-202ENST00000420138 CTDNEP1O95476 244 aa24.69■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 PTGER2P43116 358 aa24.69■■□□□ 1.54
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GPC1-202ENST00000420138 USP17L21D6R901 530 aa24.68■■□□□ 1.54
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GPC1-202ENST00000420138 EVX2Q03828 476 aa24.68■■□□□ 1.54
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GPC1-202ENST00000420138 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 KRT23Q9C075 422 aa24.68■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 CHD4Q14839 1912 aa24.68■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.68■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 C21orf2O43822 256 aa24.68■■□□□ 1.54
GPC1-202ENST00000420138 LDHCP07864 332 aa24.68■■□□□ 1.54
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