RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 MAPK8P45983 427 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 FAAP100Q0VG06 881 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 MAP7Q14244 749 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 FBXL6Q8N531 539 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 FBF1Q8TES7 1133 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PRR19A6NJB7 356 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 AOC2O75106 756 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ATP2B2Q01814 1243 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ASB16Q96NS5 453 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 WDR18Q9BV38 432 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PIM2Q9P1W9 311 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 MED26O95402 600 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 F13BP05160 661 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ERCC3P19447 782 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ASPAP45381 313 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF428Q96B54 188 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KRT82Q9NSB4 513 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 FAM105AQ9NUU6 356 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 LEMD3Q9Y2U8 911 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 NFICP08651 508 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SLFN14P0C7P3 912 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 LIG1P18858 919 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SPINK2P20155 84 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 GSTT1P30711 240 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ZAR1Q86SH2 424 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 GIPC1O14908 333 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 TMPRSS2O15393 492 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 CYP27A1Q02318 531 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ID3Q02535 119 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 DTX1Q86Y01 620 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SULF2Q8IWU5 870 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KCNB2Q92953 911 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PIDD1Q9HB75 910 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SPG7Q9UQ90 795 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF862O60290 1169 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 FOSL1P15407 271 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 NME2P22392 152 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 ADMP35318 185 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 CEP44Q9C0F1 390 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-207ENST00000418674 SAMM50Q9Y512 469 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-207ENST00000418674 CYP26A1O43174 497 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 WNT11O96014 354 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ARNTP27540 789 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PDZD3Q86UT5 571 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 SHISA5Q8N114 240 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 GATA6Q92908 595 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 SETDB2Q96T68 719 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 CBX8Q9HC52 389 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 P4HBP07237 508 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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