RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 PASKQ96RG2 1323 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 TRAF5O00463 557 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 MAGEB6Q8N7X4 407 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 OSBPL3Q9H4L5 887 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 VEZTQ9HBM0 779 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 PPP4R2Q9NY27 417 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 BTDP43251 543 aa36.52■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 MYH7P12883 1935 aa36.51■■■■□ 3.44
PKDCC-202ENST00000401498 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa36.5■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 PDE6AP16499 860 aa36.49■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 CYP7A1P22680 504 aa36.49■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 CACNB3P54284 484 aa36.49■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 USP40Q9NVE5 1235 aa36.49■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 KBTBD3Q8NAB2 608 aa36.48■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB129Q9H1M3 183 aa36.47■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa36.46■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 TCP10L2B9ZVM9 353 aa36.46■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 CHGBP05060 677 aa36.46■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 RHBDL3P58872 404 aa36.46■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP36.45■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 TMOD2Q9NZR1 351 aa36.45■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.45■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF532Q9HCE3 1301 aa36.45■■■■□ 3.43
PKDCC-202ENST00000401498 ADD2P35612 726 aa36.44■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 PPP4CP60510 307 aa36.44■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 SLFNL1Q499Z3 407 aa36.44■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 FKBP1CQ5VVH2 108 aa36.44■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa36.44■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 NFIAQ12857 509 aa36.43■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 TNFAIP1Q13829 316 aa36.43■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 RASA3Q14644 834 aa36.43■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 CDCA5Q96FF9 252 aa36.43■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 CNTNAP1P78357 1384 aa36.42■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 BAG3O95817 575 aa36.42■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 MIGA1Q8NAN2 632 aa36.42■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 IDI2Q9BXS1 227 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 FAM198AQ9UFP1 575 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 RFX7Q2KHR2 1363 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 TNNI2P48788 182 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 UBE3CQ15386 1083 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 CST9Q5W186 159 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 FAM83AQ86UY5 434 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 SKAP1Q86WV1 359 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 EVI5LQ96CN4 794 aa36.4■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 FSD1Q9BTV5 496 aa36.39■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM39BQ9GZU3 492 aa36.39■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa36.39■■■■□ 3.42
PKDCC-202ENST00000401498 APLP1P51693 650 aa36.38■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF408Q9H9D4 720 aa36.38■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 CELF2O95319 508 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 PLCG2P16885 1265 aa36.37■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 TEPSINQ96N21 525 aa36.37■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 TCP10Q12799 353 aa36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 CDAN1Q8IWY9 1227 aa36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 RGS3P49796 1198 aa36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 ZFPM1Q8IX07 1006 aa36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 TEX11Q8IYF3 940 aa36.36■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa36.35■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 FAM151AQ8WW52 585 aa36.35■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 FOCADQ5VW36 1801 aa36.34■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 AK9Q5TCS8 1911 aa36.34■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA6P17066 643 aa36.34■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 TTC22Q5TAA0 569 aa36.34■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 PICALMQ13492 652 aa36.33■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 RILPL2Q969X0 211 aa36.33■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM88BA6NKF7 163 aa36.32■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 ENTPD3O75355 529 aa36.32■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 CERS3Q8IU89 383 aa36.32■■■■□ 3.41
PKDCC-202ENST00000401498 NPM3O75607 178 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 SSC5DA1L4H1 1573 aa36.31■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 LCORLQ8N3X6 602 aa36.31■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 APPBP2Q92624 585 aa36.31■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa36.3■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 OSBP2Q969R2 916 aa36.3■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 MBD4O95243 580 aa36.29■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa36.29■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 ARMT1Q9H993 441 aa36.29■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 CREBZFQ9NS37 354 aa36.28■■■■□ 3.4
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