RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 LY9Q9HBG7 655 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PQ27 194 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PQ64 194 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PQD8 194 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 LIFRP42702 1097 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 KRT23Q9C075 422 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 CLIC4Q9Y696 253 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 RXRAP19793 462 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 TDO2P48775 406 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 STX1AQ16623 288 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 LCORLQ8N3X6 602 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ALG1Q9BT22 464 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 BCORQ6W2J9 1755 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 KIF28PB7ZC32 967 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 CDC27P30260 824 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SPC24Q8NBT2 197 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SENP2Q9HC62 589 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SPTLC2O15270 562 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 PRKAB2O43741 272 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ERFEQ4G0M1 354 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 INCENPQ9NQS7 918 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 CCDC69A6NI79 296 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 PHKBQ93100 1093 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 IARSP41252 1262 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ANO1Q5XXA6 986 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GVL5 298 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 UBE4AQ14139 1066 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 NTRK3Q16288 839 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 AIFM3Q96NN9 605 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 TRIM5Q9C035 493 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-202ENST00000398743 COL4A1P02462 1669 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA8P51970 172 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 IQCB1Q15051 598 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 KRT40Q6A162 431 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 VPS37DQ86XT2 251 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 MYL10Q9BUA6 226 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 ANO10Q9NW15 660 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 STK36Q9NRP7 1315 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 RGL2O15211 777 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 CYP7A1P22680 504 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 ZNF75DP51815 510 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 PIP4K2BP78356 416 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 TRIM29Q14134 588 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 SDF4Q9BRK5 362 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 TOMM22Q9NS69 142 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 ABCF2Q9UG63 623 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 NID2Q14112 1375 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 GYG1P46976 350 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 MTA3Q9BTC8 594 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 RAI14Q9P0K7 980 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 ERICH2A1L162 156 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 WTAPQ15007 396 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRAME-202ENST00000398743 DRC7Q8IY82 874 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms