RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395713.6

TRPS1-202, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 KCNB2Q92953 911 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 CORO1BQ9BR76 489 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 TINF2Q9BSI4 451 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 SPON2Q9BUD6 331 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 USP26Q9BXU7 913 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 PIK3R2O00459 728 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 DLL1O00548 723 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 SEPT6Q14141 434 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-202ENST00000395713 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GREM1O60565 184 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 PODNQ7Z5L7 613 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 TRIM37O94972 964 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 DLGAP3O95886 979 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 F13A1P00488 732 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 PDE3AQ14432 1141 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF862O60290 1169 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 WISP1O95388 367 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 LIG1P18858 919 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GPRASP2Q96D09 838 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 UBP1Q9NZI7 540 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 NCAPD3P42695 1498 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 FAM221AA4D161 298 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 ELNP15502 786 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GJA8P48165 433 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GRIK4Q16099 956 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 KRT82Q9NSB4 513 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 CRKP46108 304 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 FBXO27Q8NI29 283 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 CILPO75339 1184 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 SELPP16109 830 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 COL8A1P27658 744 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 CDK8P49336 464 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 ACAD11Q709F0 780 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 NKD1Q969G9 470 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 RAD18Q9NS91 495 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-202ENST00000395713 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 AOC2O75106 756 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 APOBRQ0VD83 1088 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 MPP2Q14168 576 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 VPS37DQ86XT2 251 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 WDR18Q9BV38 432 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 BPNT1O95861 308 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 ARID5AQ03989 594 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 INPP5AQ14642 412 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 SEZ6Q53EL9 994 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-202ENST00000395713 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms