RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 APOA5Q6Q788 366 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 C8orf76Q96K31 380 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 KDM4AO75164 1064 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 BICD2Q8TD16 824 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 USP28Q96RU2 1077 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 LY9Q9HBG7 655 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 RFC4P35249 363 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 CAMK4Q16566 473 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 ATL3Q6DD88 541 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 RXRAP19793 462 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 UVSSAQ2YD98 709 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.74■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 TM4SF1P30408 202 aa26.73■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.73■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.73■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 KRT23Q9C075 422 aa26.73■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K11Q16584 847 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 CACNA1SQ13698 1873 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 NR1I2O75469 434 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 CLCN1P35523 988 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 MICU3Q86XE3 530 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.72■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB43O43298 467 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 CDC27P30260 824 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 LIFRP42702 1097 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 TNMDQ9H2S6 317 aa26.71■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 NPHP1O15259 732 aa26.7■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 HSPA1LP34931 641 aa26.7■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 SEMA3EO15041 775 aa26.7■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CCDC192P0DO97 292 aa26.7■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 HS1BP3Q53T59 392 aa26.7■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.7■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 ZNF384Q8TF68 577 aa26.7■■□□□ 1.86
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SNX18-201ENST00000326277 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 MYL10Q9BUA6 226 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 TOMM22Q9NS69 142 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CDKL5O76039 1030 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 PPARAQ07869 468 aa26.69■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 NFIXQ14938 502 aa26.68■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.68■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CCDC69A6NI79 296 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 NTRK3Q16288 839 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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SNX18-201ENST00000326277 PHKBQ93100 1093 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 AIFM3Q96NN9 605 aa26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 ALG1Q9BT22 464 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 USP25Q9UHP3 1055 aa26.66■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 KIF28PB7ZC32 967 aa26.65■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 TYRO3Q06418 890 aa26.65■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 BRAPQ7Z569 592 aa26.65■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 RGS22Q8NE09 1264 aa26.65■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.65■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.64■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SNX18-201ENST00000326277 SMIM22K7EJ46 135 aa26.64■■□□□ 1.85
SNX18-201ENST00000326277 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
SNX18-201ENST00000326277 ME1P48163 572 aa26.64■■□□□ 1.85
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