RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 SPECC1Q5M775 1068 aa27.4■■□□□ 1.98
PINK1-201ENST00000321556 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.4■■□□□ 1.98
PINK1-201ENST00000321556 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PINK1-201ENST00000321556 PDE6AP16499 860 aa27.39■■□□□ 1.98
PINK1-201ENST00000321556 APOA5Q6Q788 366 aa27.39■■□□□ 1.98
PINK1-201ENST00000321556 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.39■■□□□ 1.98
PINK1-201ENST00000321556 C4AP0C0L4 1744 aa27.39■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 C4BP0C0L5 1744 aa27.39■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 TICAM2Q86XR7 235 aa27.39■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.39■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.39■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 STARD3NLO95772 234 aa27.38■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.38■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.38■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 ZMYM6O95789 1325 aa27.38■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 NPHP1O15259 732 aa27.38■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 SHC4Q6S5L8 630 aa27.37■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 A0A0G2JS52 829 aa27.37■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 NLRP12P59046 1061 aa27.37■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 SLC39A14Q15043 492 aa27.37■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.37■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 PDE8BO95263 885 aa27.36■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 CMA1P23946 247 aa27.36■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 SYKP43405 635 aa27.36■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 GOLGA8FQ08AF8 430 aa27.36■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.36■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 ARMT1Q9H993 441 aa27.35■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 PRKAB2O43741 272 aa27.35■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.35■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 TOMM22Q9NS69 142 aa27.35■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.35■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 DPF2Q92785 391 aa27.34■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 MBD4O95243 580 aa27.33■■□□□ 1.97
PINK1-201ENST00000321556 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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PINK1-201ENST00000321556 NTRK3Q16288 839 aa27.32■■□□□ 1.96
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PINK1-201ENST00000321556 GRIN1Q05586 938 aa27.31■■□□□ 1.96
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PINK1-201ENST00000321556 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 NAPBQ9H115 298 aa27.3■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 GSDMDP57764 484 aa27.29■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 BTBD18B2RXH4 712 aa27.29■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 SMIM22K7EJ46 135 aa27.29■■□□□ 1.96
PINK1-201ENST00000321556 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.29■■□□□ 1.96
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