RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 VSTM4Q8IW00 320 aa25.04■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 MAP3K14Q99558 947 aa25.04■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 TJP1Q07157 1748 aa25.04■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 TMEM139Q8IV31 216 aa25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.03■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 SYNE4Q8N205 404 aa25.02■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.02■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 MNS1Q8NEH6 495 aa25.02■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 WDR24Q96S15 920 aa25.02■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 ZMYM6O95789 1325 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 TADA3O75528 432 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 FAM89AQ96GI7 184 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 CPDO75976 1380 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 B4E1Z4 1266 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 GRIN1Q05586 938 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 ZNF827Q17R98 1081 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 RESP18Q5W5W9 173 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 TIGD1Q96MW7 591 aa25.01■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 C4AP0C0L4 1744 aa25■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 C4BP0C0L5 1744 aa25■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 PDILTQ8N807 584 aa25■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 KIF1AQ12756 1690 aa25■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 APPP05067 770 aa25■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 MCAMP43121 646 aa25■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 APOA5Q6Q788 366 aa24.99■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 TMEM94Q12767 1356 aa24.99■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.98■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 CBFA2T2O43439 604 aa24.98■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 PPP6R2O75170 966 aa24.98■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.98■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.98■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 SASH3O75995 380 aa24.97■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 PRR29P0C7W0 189 aa24.97■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.97■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.97■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 TICAM2Q86XR7 235 aa24.97■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 DESI2Q9BSY9 194 aa24.97■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 TAF3Q5VWG9 929 aa24.96■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB9Q96C00 473 aa24.96■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.96■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.96■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 GUCY1A2P33402 732 aa24.96■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.95■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 NTRK3Q16288 839 aa24.95■■□□□ 1.59
ELL3-201ENST00000319359 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.95■■□□□ 1.59
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ELL3-201ENST00000319359 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ELL3-201ENST00000319359 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.94■■□□□ 1.58
ELL3-201ENST00000319359 TUBB4AP04350 444 aa24.94■■□□□ 1.58
ELL3-201ENST00000319359 ADD2P35612 726 aa24.94■■□□□ 1.58
ELL3-201ENST00000319359 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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ELL3-201ENST00000319359 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ELL3-201ENST00000319359 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.94■■□□□ 1.58
ELL3-201ENST00000319359 TC2NQ8N9U0 490 aa24.94■■□□□ 1.58
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