RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 RASGRF1Q13972 1273 aa22.72■■□□□ 1.23
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SPNS1-201ENST00000311008 JMYQ8N9B5 988 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GVL5 298 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFA8P51970 172 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 MTA3Q9BTC8 594 aa22.71■■□□□ 1.23
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SPNS1-201ENST00000311008 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.7■■□□□ 1.23
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SPNS1-201ENST00000311008 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.7■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.7■■□□□ 1.23
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SPNS1-201ENST00000311008 STK36Q9NRP7 1315 aa22.7■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 MBD4O95243 580 aa22.7■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 TRIM29Q14134 588 aa22.7■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 VPS37DQ86XT2 251 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.68■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 NID2Q14112 1375 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 RREB1Q92766 1687 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.67■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 NTSR2O95665 410 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-201ENST00000311008 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 TPM4P67936 248 aa22.65■■□□□ 1.22
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SPNS1-201ENST00000311008 NLRP12P59046 1061 aa22.64■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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SPNS1-201ENST00000311008 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-201ENST00000311008 PHLPP1O60346 1717 aa22.63■■□□□ 1.21
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