RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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HOXD4-201ENST00000306324 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 SKAP1Q86WV1 359 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 SULF1Q8IWU6 871 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 FSD1Q9BTV5 496 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 USP40Q9NVE5 1235 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 CACNB3P54284 484 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 USP48Q86UV5 1035 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
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HOXD4-201ENST00000306324 ADD2P35612 726 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 FSTL1Q12841 308 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 RILPL2Q969X0 211 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 EVI5LQ96CN4 794 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD4-201ENST00000306324 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 BAG3O95817 575 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 CHGBP05060 677 aa27■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 TRAF5O00463 557 aa27■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 RGS3P49796 1198 aa27■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 TTC22Q5TAA0 569 aa27■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 DLK2Q6UY11 383 aa27■■□□□ 1.91
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HOXD4-201ENST00000306324 RHBDL3P58872 404 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 UBE3CQ15386 1083 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 PLCG2P16885 1265 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 TNNI2P48788 182 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 PPP4CP60510 307 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD4-201ENST00000306324 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
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HOXD4-201ENST00000306324 RASA3Q14644 834 aa26.96■■□□□ 1.91
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HOXD4-201ENST00000306324 TEX11Q8IYF3 940 aa26.96■■□□□ 1.91
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HOXD4-201ENST00000306324 PICALMQ13492 652 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 CDCA5Q96FF9 252 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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HOXD4-201ENST00000306324 APPBP2Q92624 585 aa26.93■■□□□ 1.9
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HOXD4-201ENST00000306324 IDI2Q9BXS1 227 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 PASKQ96RG2 1323 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 CNTNAP1P78357 1384 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 MBD4O95243 580 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 C1QTNF8P60827 252 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 FAM83AQ86UY5 434 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 MYH1P12882 1939 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 SDSP20132 328 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 LCORLQ8N3X6 602 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 AIDAQ96BJ3 306 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 ARMT1Q9H993 441 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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HOXD4-201ENST00000306324 OSBP2Q969R2 916 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 FAM151AQ8WW52 585 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 ENTPD3O75355 529 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 USP5P45974 858 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXD4-201ENST00000306324 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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