RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrit1Q8K099 624 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bap1Q99PU7 728 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ush1cQ9ES64 910 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CrcpO35427 148 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bnip3O55003 187 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cnnm2Q3TWN3 875 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hvcn1Q3U2S8 269 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plcd3Q8K2J0 785 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Emilin2Q8K482 1074 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tktl2Q9D4D4 627 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ParvgQ9ERD8 331 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cxcl11Q9JHH5 100 aa11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Heg1E9Q7X6 1337 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtx1P47802 317 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc7a3P70423 618 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm28047Q3US59 414 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Agtpbp1Q641K1 1218 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam170aQ66LM6 333 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr3gQ6NXY9 223 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oxsr1Q6P9R2 527 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tsen34Q8BMZ5 316 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Paf1Q8K2T8 535 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tulp1Q9Z273 543 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Celf1P28659 486 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxp1P58462 705 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Epha2Q03145 977 aa11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tuft1O08970 390 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppfibp2O35711 882 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Becn1O88597 448 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Me1P06801 572 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pde11aP0C1Q2 933 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CerkQ8K4Q7 531 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hps3Q91VB4 1002 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cnpy3Q9DAU1 276 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Suclg2Q9Z2I8 433 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dennd3A2RT67 1274 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prl7d1P04769 244 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EzrP26040 586 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 U2af2P26369 475 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps8P62242 208 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gzf1Q4VBD9 706 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acnat2Q8BGG9 420 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9230110C19RikQ8CC70 267 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cypt1Q8CH20 168 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MypopQ8R4U1 393 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc2Q8VDB8 371 aa11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map3k15A2AQW0 1331 aa11.9□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubn2Q80WC1 1314 aa11.9□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfyve9A2A8R0 1397 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mei1Q9D4I2 1268 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myh13B1AR69 1938 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif3aP28741 701 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec23aQ01405 765 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnf1Q7TSH7 493 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpatch3Q8BIY1 525 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HlfQ8BW74 295 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Terb1Q8C0V1 768 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MlphQ91V27 590 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NenfQ9CQ45 171 aa11.89□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ltn1Q6A009 1767 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aknad1E9Q8N6 675 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sema6bO54951 886 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CebpaP53566 359 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dynll1P63168 89 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glis3Q6XP49 780 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Otop3Q80UF9 577 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hook1Q8BIL5 728 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccer1Q9CQL2 403 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700018B08RikQ9DA83 213 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efcc1Q9JJF6 558 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IbspQ61711 324 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr118Q7TRJ6 321 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc12Q8BW49 704 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubxn4Q8VCH8 506 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stk38Q91VJ4 465 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aox3G3X982 1335 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgap33Q80YF9 1305 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntnap1O54991 1385 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubr3Q5U430 1889 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf609Q8BZ47 1413 aa11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnm1P39053 867 aa11.87□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il15P48346 162 aa11.87□□□□□ -0.51
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HelbQ6NVF4 1074 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.3 ms